一、 实验原理:
CRISPR/Cas9 源自细菌及古菌中用以抵御病毒和外源 DNA 入侵的免疫调控系统 。 crRNA( CRISPR-derived RNA) tracrRNA( trans-activating RNA) 配对形成复合物能 特异识别基因组序列 , 引导 Cas9 核酸内切酶对目的片段进行切割 ,对这两种 RNA 进行二 合一优化获得 sgRNA( single-guide RNA) 同样能引导 Cas9 进行靶向切割。利用其特异 性靶向功能 ,可实现基因的精准编辑 ,包括基因敲除、敲入和点突变等等。该系统已被广泛 应用于斑马鱼、小鼠、大鼠、秀丽隐杆线虫、植物及细菌等多种生物体的基因编辑。
CRISPR-Cas9 系统编辑切割产生 DNA 双链断裂( Double-Strand Breaks, DSBs) ,可 诱 发 DNA 的 自 然 修 复 机 制 。 双 链 断 裂 的 DNA 一 般 通 过 非 同 源 末 端 重 组 ( Non- homologous End Joining-NHEJ)或者同源重组修复( HDR)方式进行修复。非同源末端 连接( Non-homologous End Joining-NHEJ)是真核生物细胞在不依赖 DNA同源性的情 况下 ,而为了避免 DNA 或染色体断裂( Breab ,产生功能性敲除。具体原理如图所示:
二二、项目描述:
客户提供 RAW264.7 细胞,针对基因 AMPK( Gene ID: 105787)进行功能性敲除 ,获得 多克隆细胞系。
三、实验材料:
1 .细胞株
RAW264.7 细胞 :公司提供。
2.主要试剂:
1 胎牛血清( OPCEL)
2 DMEM(gibco)
3 0.25% Trypsin-EDTA (gibco)
4 PenStre双抗(gibco)
5 TIANamp Genomic DNA Kit ( TIANGEN)
6 2x EasyTaq PCR SurperMix( Trans)
3. 仪器耗材:
1 生物安全柜 :Thermo
2 二氧化碳培养箱 :Thermo
3 荧光显微镜: Nikon
4 低温冰箱: Haier
5 -80℃冰箱 :Thermo
6 细胞培养皿: Costar
7 低温高速离心机 :Thermo
8 PCR 仪 :Thermo